Tokyo possède l'économie urbaine la plus développée au monde avec un PNB de 1191 milliards de dollars en 2005. Tokyo est une place financière internationale qui héberge quelques-unes des plus grandes compagnies d'assurances et d'investissements bancaires, ainsi que le siège des compagnies de transports, des maisons d'édition et de la presse et télévision nationales. La période de croissance économique japonaise qui a suivi la seconde guerre a poussé de nombreuses grandes entreprises à délocaliser leurs bureaux de villes telles qu'Osaka (la capitale historique du commerce japonais) à Tokyo. Ces déménagements permirent aux entreprises de se rapprocher du gouvernement. La surpopulation et le coût très élevé de la vie dans la capitale ont cependant ralenti cette tendance ces dernières années. Tokyo reste l'une des villes les plus chères au monde.

La Bourse de Tokyo est la deuxième place boursière mondiale derrière New York, et lorsque l'économie japonaise était à son zénith au début des années 90, celle-ci renfermait plus 60% des valeurs boursières internationales.

On ne trouve que 8000 hectares de terres cultivables à Tokyo, et ce principalement à l'Ouest de la ville. La grande couronne renferme de nombreuses forêts, principalement dans les régions montagneuses de l'Ouest. L'exportation de bois est cependant en déclin à cause notamment de la chute des prix, de la hausse des coûts de production et du vieillissement de la population dans les zones d'exploitation. La baie de Tokyo était jadis une importante source de poisson mais le plus gros de la production actuelle de la ville provient des îles du Pacifique qui y sont rattachées. Le tourisme est évidemment une autre source de revenus pour l'économie de Tokyo.