L'occupation Romaine de la région de Francfort commença dès le 1er siècle après J.C. On considère en générale que Francfort date du 8ème siècle, quand la ville fut hérigé par les Carolingiens. A la fin du 8ème siècle, Einhard, le biographe de Charlemagne, utilisa le nom 'Frankonovurd' duquel vient, en tout probabilité, l'appellation moderne de Francfort. Pendant son règne (800-814), Charlemagne fit construire un palais dans la ville et présida un synod clérical (assemblée des dirigeants de l'église). Francfort était une ville importante pendant la période du Saint Empire Romain et fut le site des nominations des empereurs allemand depuis 855.

Francfort fut, en effet, la capitale de l'Empire Allemand pendant les deux dynasties qui suivèrent les Carolingiens et c'est pendant cette période que les foires commerciales pour lesquelles Francfort devint célèbre ont commencé. En 1372, la ville se transforma en une 'cité impériale', dirigée directement par le Saint Empereur Romain. Entre 1562 et 1792, les empereurs allemand étaient élus et couronnés à Francfort.

Pendant les guerres Napoléoniennes, Francfort fut occupé et attaqué par les forces Françaises, bien qu'elle resta une ville libre jusqu'à la fin du Saint Empire Romain en 1805 et fut absorbée dans la confédération du Rhin, devenant ainsi la capitale du Grand Duché de Francfort en 1806. Ce changement n'a pas durée longtemps, et le congrès de Vienne en 1815 rattacha la ville à la Confédération Allemande, bien que Francfort demeura ville libre. En 1866, pendant la guerre Austro-Prussienne, la ville fut annexée par le Royaume de Prusse est rattachée aux régions du Cassel et Wiesbaden.

En 1870, la traité qui termina la guerre entre la France et Allemagne fut signé à Francfort.

Pendant la Seconde Guerre Mondiale, la ville fut presque entièrement détruite par les bombes Alliées, et 5.500 de ses citoyens mourrèrent. Quelques bâtiments d'intérêt historique furent reconstruit, mais le plupart de la ville fut refaite dans un esprit plus moderne.