La Región de la Capital Nacional incluye Tokio y sus veintitrés salas (o distritos) y siete en torno a las prefecturas, en su mayor parte regulado por el Gobierno Metropolitano de Tokio, cuyas oficinas principales están ubicadas en el barrio de Shinjuku. Además de la administración de Tokio, el Gobierno Metropolitano de sí mismo también es responsable de veintiséis ciudades suburbanas a la Zona de Tama, en el oeste, y una serie de pequeñas islas que se extienden unos mil kilómetros en el Océano Pacífico. La prefectura de Tokio está legislado por la Asamblea Metropolitana, que consiste de 127 miembros electos. Las elecciones tienen lugar cada cuatro años, el próximo será en 2009. Todos los principales partidos políticos nacionales están representados en la Asamblea de Tokio, con la excepción del Partido Social Demócrata, que perdieron sus puestos durante las últimas elecciones. El Partido Liberal Democrático tiene la mayoría en la actual Asamblea.

El autor y Shintaro Ishihara político ha sido el gobernador de Tokio desde 1999. Él es una figura polémica, famoso por criticar a los Estados Unidos, China y el gobierno central, y por una vez de haber dicho que el Japón "is el Cáucaso no sólo para la sociedad moderna han creado una superpotencia. "Apenas dos meses antes de graduarse de la universidad de Ishihara Japón ganó más prestigiosos premio literario por su novela Temporada de Sun. El libro se hizo en una película y dos de Ishihara y su hermano Yujiro, que desempeñó un papel de apoyo, se encuentran en el centro de un culto a la juventud-orientada. Su distinguida carrera política comenzó con su elección a la Cámara de Consejeros en 1968, y sus obras literarias siguen siendo publicados desde entonces. Dos de sus cuatro hijos también están en la política y tienen asientos en la Cámara de Representantes.