Die National Capital Region umfasst Tokio und seine zwanzig bis drei Stationen (oder Bezirke) und sieben umliegenden Präfekturen, zum größten Teil durch das Tokyo Metropolitan Government, deren Hauptsitz befindet sich in Shinjuku Station. Neben der Verwaltung von Tokyo Metropolitan sich die Regierung auch für die sechsundzwanzig Vorort Städte im Westen in der Tama-Gebiet, und eine Reihe von kleinen Inseln, die sich einige Tausend Kilometer in den Pazifischen Ozean. Die Präfektur Tokio ist gesetzlich durch die Metropolitan Versammlung, die aus 127 gewählten Mitgliedern. Die Wahlen finden alle vier Jahre statt, die nächste wird im Jahr 2009. Alle großen politischen Parteien sind in der Tokio-Versammlung, mit Ausnahme der Sozialdemokratischen Partei, die ihre Sitze verloren, während der letzten Wahl. Die liberale Demokratische Partei hat die Mehrheit in der aktuellen Versammlung.

Der Autor und Politiker Shintaro Ishihara wurde der Gouverneur von Tokio seit 1999. Er ist eine umstrittene Persönlichkeit, berühmt für die Kritik an den Vereinigten Staaten, China und die zentrale Regierung, und einmal mit, dass Japan "is das einzige nicht-kaukasischen Gesellschaft haben eine moderne Supermacht. "Nur zwei Monate vor Abschluss von der University Ishihara Japan gewann der renommiertesten Literaturpreis für seinen Roman Jahreszeit von der Sonne. Das Buch wurde zu einem Film, und beide Ishihara und sein Bruder Yujiro, die eine unterstützende Rolle spielen, fanden sich in der Mitte der Jugend-Kult. Seine politische Karriere begann sich mit seiner Wahl in das Haus der Räte im Jahre 1968, und seine literarischen Werke weiterhin veröffentlicht werden seit dieser Zeit. Zwei der seine vier Söhne sind auch in der Politik und halten Sitze in der Abgeordnetenkammer.